卫健局是负责地方公共卫生、医疗机构管理的政府机关。主要职责如下：
- 医疗护理质量管理
- 医疗纠纷处理
- 疾病预防控制
- 妇幼保健
- 卫生监督
- 爱国卫生运动
- 突发公共卫生事件应对
- 艾滋病防治
- 新农合基金管理
国家卫生健康委员会内设机构
国家卫生健康委员会设有以下内设机构：
- 办公厅
- 人事司
- 规划发展与信息化司
- 财务司
- 法规司
- 体制改革司
- 疾病预防控制局
- 医政医管局
- 基层卫生健康司
- 卫生应急办公室（突发公共卫生事件应急指挥中心）
- 科技教育司
- 综合监督局
- 药物政策与基本药物制度司
- 食品安全标准与监测评估司
- 老龄健康司
- 妇幼健康司
- 职业健康司
- 人口监测与家庭发展司
- 宣传司
- 国际合作司（港澳台办公室）
